Depuis 2003, la Patrouille de France apporte son soutien à des associations en réalisant des partenariats.
Elle a débuté cette initiative avec la Croix-Rouge française.
En 2008, un partenariat est monté avec Mécénat Chirurgie Cardiaque, association qui sauve des enfants du monde entier en les faisant venir se faire opérer en France, et se poursuit jusqu'en 2010.
En 2011, la Patrouille de France soutient la Fondation Thierry Latran (recherche contre la sclérose latérale amyotrophique ou maladie de Charcot), et soutient également l'association Solid'Air, qui œuvre au profit de personnel de l'armée de l'air qui est directement confronté à un handicap (ou au sein de sa famille).
En 2012, l'armée de l'air devient partenaire de « Tout le monde chante contre le cancer ». La Patrouille de France effectue 3 passages historiques dans le ciel de Villefranche de Rouergue, siège social de cette association aveyronnaise19.
En 2017 et 2018, la Patrouille de France soutient l'association « Sourire à la vie ».
Depuis 2019, la Patrouille de France soutient l'association « Imagine For Margo - Children without Cancer ».
